LAMMPS
한국어 입문 가이드

LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)는 미국 Sandia 국립연구소에서 개발하는 고전 분자동역학(MD) 시뮬레이션 패키지입니다. 원자·분자 수준의 시스템을 수십 개부터 수십억 개 입자까지 다룰 수 있으며, 학술용으로 무료로 배포됩니다.

본 가이드는 LAMMPS를 처음 접하는 사용자가 매뉴얼의 방대한 분량 앞에서 길을 잃지 않도록 정리한 한국어 입문서입니다. 가장 단순한 Lennard-Jones 액체 예제부터 시작해 입력 스크립트의 4단계 구조, 단위계와 원자 표현, 상호작용 모델, 시뮬레이션 설정, 출력과 분석까지 차근차근 다룹니다.

이 가이드에 관하여

본 가이드는 LAMMPS 공식 매뉴얼(2024년 기준)을 토대로 일상 연구에서 가장 자주 등장하는 명령과 패턴을 추려 정리했습니다. 모든 예제는 LAMMPS 22 Jul 2024 안정 버전을 기준으로 작성되었으며, 그 이전 버전들과도 대부분 호환됩니다.

각 페이지 좌측 사이드바에서 원하는 주제로 바로 이동할 수 있고, 페이지 하단의 이전·다음 링크로 순서대로 읽을 수 있습니다. 명령어 이름은 모두 매뉴얼의 원어 표기를 그대로 사용했으며, 상세 옵션이나 특수 사용 사례는 원문 매뉴얼 (docs.lammps.org)을 직접 참조하시기를 권합니다.

주제별로 들어가기

처음 시작한다면

시뮬레이션 만들기

결과 보기와 운영

예제 따라 하기

각 예제는 목적 → 입력 스크립트 → 실행 → 출력·그림 순으로 자체완결 페이지에 정리돼 있습니다.

응용 예제: Cu 표면 흡착

본 입문 가이드를 끝낸 다음, 실제 연구 문제에 LAMMPS를 어떻게 적용했는지 보여주는 응용 시리즈가 있습니다. Cu(100)/Cu(111) 표면 위 벤젠-에탄올 경쟁 흡착을 OPLS-AA · TraPPE-UA · PPPM · MSM 네 조합으로 비교하는 9개 챕터입니다.

인용에 관하여

LAMMPS를 사용한 연구를 발표할 때는 다음 일반 인용을 함께 표기하시기 바랍니다. 여기에 더해, 실제로 사용한 모델(예: ReaxFF, EAM, COMPASS 등)의 원저 논문도 함께 인용하는 것이 학계의 관례입니다.

• Thompson, A. P.; Aktulga, H. M.; Berger, R.; Bolintineanu, D. S.; Brown, W. M.; Crozier, P. S.; in 't Veld, P. J.; Kohlmeyer, A.; Moore, S. G.; Nguyen, T. D.; Shan, R.; Stevens, M. J.; Tranchida, J.; Trott, C.; Plimpton, S. J. Comput. Phys. Commun. 2022, 271, 108171.
• Plimpton, S. J. Comput. Phys. 1995, 117, 1–19.